生殖道支原体具有无细胞存在的能力。它们的特征在于缺乏刚性细胞，其赋予细胞多形性特征，但也使它们极易受到脱水的影响。
尽管一些物种可以存在于女性生殖道的共生菌群，解脲支原体，人型支原体和生殖支原体已被证明会导致几个不同的临床实体。这些可能包括细菌性阴道病和宫颈炎，以及对女性生育能力的不利影响。
女性常见临床综合症
细菌性阴道病是由各种微生物的协同过度生长引起的阴道炎症，生殖器支原体在与阴道加德纳菌和厌氧细菌相关的发育中起主要作用。无论解脲支原体和人型支原体已链接到细菌性阴道病，造成62-92%和案件的58-76%之间。
此外，有人提出生殖支原体和宫颈炎之间的关联(即子宫颈内膜的炎症或刺激)，尽管确切的机制仍存在争议。与不携带支原体生殖器的妇女相比，患有此类宫颈炎的妇女更经常报告阴道性交后出血。
宫颈炎通常发生在盆腔炎(PID)之前，这是一种严重的上生殖道感染，可能对生殖健康产生影响。微生物从下生殖器区域上升到子宫，输卵管和卵巢。一项针对临床疑似PID的女性的大型研究表明，生殖道支原体在这种疾病中与沙眼衣原体和淋病奈瑟菌一样普遍。
人体支原体对实验室环境中输卵管上皮衬里的不良影响是在四十多年前建立的，这种病原体已从子宫内膜(子宫内膜)和输卵管中分离出约10%输卵管炎的女性(即输卵管的急性炎症)。此外，人型支原体与原生动物寄生虫阴道毛滴虫的共生关系可能导致共感染，反过来又使临床表现恶化。
