由于可能出现各种各样的症状，异位妊娠被称为“伟大的伪装者”。经典的症状三联症 - 腹痛，停经和阴道异常出血 - 并不总是存在，并且异位妊娠经常被误诊。
在输卵管妊娠中，更常见和一致的抱怨是疼痛。这种疼痛通常发生在怀孕早期，可能是由于输卵管腔的扩张。一些患者经历一周或更长时间的疼痛，而大量患者报告的急性疼痛持续时间不到一天。疼痛往往模糊不清，但可能是绞痛或痉挛。虽然经常局限于右侧或左侧骨盆区域，但疼痛可能出现在整个腹部或腰部。由于腹痛是早孕的意外症状，因此它是病理状态存在的有价值线索。输卵管破裂引起显着症状。腹痛; 单侧，可触及的盆腔肿块; 并且血细胞比容下降表明缓慢破裂。急性单侧腹痛是急性破裂的特征，并且快速失血会导致晕厥和休克。膈肌下可能出现血液汇集，可能会出现肩关节疼痛。腹部反弹和Cullen的征象，脐带区域的蓝色变色，表明大量腹腔积液。
经历异位妊娠的妇女可能会报告月经期延迟或变异; 但是，不规则时期的人可能不会意识到任何异常。大多数患者报告间歇性阴道出血。放电通常为深红色或棕色。大量出血或鲜红色出血并不常见。发生的子宫出血是由于子宫蜕膜变性和脱落，因为受精卵不能激活支持子宫内膜。6异位妊娠的激素水平的人绒毛膜促性腺激素(HCG)通常低于同一孕期的子宫妊娠。
在卵子受精后，女性的荷尔蒙反应模仿子宫妊娠，尽管个体的表观生理变化差异很大。可能发生子宫增大，并且子宫内膜可以表现出继发于激素刺激的蜕膜变化。妊娠的常见症状(例如，恶心，呕吐和乳房增大)通常不存在，因为妊娠早期并且可能是因为激素水平较低。许多女性不知道自己怀孕了。
异位妊娠经常与各种其他妇科疾病混淆。其中更常见的是子宫妊娠，伴有先兆或不完全流产，盆腔炎，卵巢囊肿和黄体囊肿。在区分不完全或先兆流产的症状与异位妊娠的症状时，医务人员应注意疼痛的类型和质量。与堕胎相关的疼痛通常不那么严重，更有节奏，并且位于低中线。在实际出血开始之前，经历过肆虐或不完全堕胎的妇女通常会有较长的停经期。出血较重且呈鲜红色。
