习惯性自然流产的原因
遗传性疾病
配偶中最常见的染色体异常导致习惯性流产，是一种代偿性易位。通常它会导致胎儿的三体性。然而，家族史数据和先前出生的信息都不允许排除染色体异常，并且只有在确定核型时才能检测到它们。除了易位，镶嵌现象，个别基因的突变和倒置可导致习惯性的自发性流产。
生殖器官的组织学可以是先天性和后天性的(缪勒管的发育缺陷，子宫颈的发育缺陷，导致缺血性宫颈机能不全的发展)。在子宫中隔，自然流产的发生率达到60%，在妊娠的第二个三个月更频繁地发生流产。生殖器官的获得性病理学增加了自发性流产的风险，是Asherman综合征，子宫粘膜下子宫肌瘤，子宫内膜异位症。虽然一些作者认为这可能是子宫肌瘤和Ascherman综合征的血流障碍以及子宫内膜异位症的免疫障碍，但在这些情况下流产的发病机制尚不清楚。
内分泌失调
在导致习惯性流产的内分泌原因中，应注意缺乏黄体，黄体生成素分泌过多，糖尿病和甲状腺疾病。黄体期失败的重要性可能是各种不同因素及其组合的结果-伴随的内分泌病理学。但今天主要的诊断标准是黄体酮的浓度。在怀孕的早期阶段，它是由黄体产生的，然后主要由滋养层产生。据信，怀孕第10周之前的流产与黄体分泌黄体酮不足或蜕膜壳和子宫内膜对其的抵抗有关。在甲状腺功能减退症中，流产与排卵受损和黄体营养不良有关。
泌尿生殖系统的炎症性疾病(VZMP)
虽然对其进行了很好的研究，但感染在习惯性自发性流产发展中的作用最具争议性。
据信由细菌，病毒和真菌(主要是支原体属，Ureaplazma spp。，Chlamidia trahomatis等)引起的VWMP被认为导致流产。
