由于月经是由体内涉及多种结构的激素的循环控制的，因此任何这些器官中的任何功能障碍或异常都可能是闭经的原因。排卵和月经所涉及的器官是下丘脑，脑下垂体，卵巢，子宫和阴道。
下丘脑
下丘脑分泌促性腺激素释放激素(GnRH)，然后作用于垂体，引发卵泡刺激素(FSH)和促黄体激素(LH)的释放。
缺乏或缺乏促性腺激素释放激素(GnRH)的一些原因包括：
遗传性疾病。
饥饿或营养不良。
饮食失调如厌食症或贪食症。
过度节食和锻炼。
对大脑的创伤。
下丘脑的肿瘤。
照射下丘脑，无论是偶然的还是由于放射治疗引起的。
麻醉药和酒精滥用。
某些药物，尤其是精神药物。
结核病和艾滋病毒/艾滋病等感染。
其他慢性疾病 - 体内重要器官的许多慢性疾病可能会影响下丘脑。
抑郁症和精神分裂症等心理或精神疾病。
心理和/或情绪压力。
垂体
垂体腺受到来自下丘脑的促性腺激素释放激素(GnRH)的刺激。来自垂体的卵泡刺激素(FSH)和促黄体激素(LH)然后作用于卵巢，引发排卵和雌激素的产生。
垂体功能障碍引起的闭经的一些原因包括：
高水平的催乳素(hyperprolocatinemia)。
对大脑的创伤。
脑垂体和周围脑组织的肿瘤。
结核病等感染。
脑垂体变性。
母乳喂养刺激催乳素的产生和分泌。这可能导致母乳喂养的母亲闭经。
卵巢
卵泡刺激激素(FSH)和黄体生成素(LH)刺激卵子成熟并释放卵细胞(卵子)。它还分泌雌激素和孕酮，以便在受孕时促进胚胎的植入。
在大多数闭经的情况下，不会发生排卵(无排卵)。这被称为无排卵性闭经。然而有时，虽然没有月经，但可能会发生排卵，这被称为排卵性闭经。
一些卵巢闭经的原因包括：
遗传性疾病。
多囊卵巢综合征(PCOS)。
像桥本氏甲状腺炎这样的自身免疫性疾病。
感染如腮腺炎和未经治疗的细菌性阴道病的并发症。
无论是意外还是由于放射治疗，都可以照射骨盆。
化疗和激素避孕药等药物。
糖尿病等慢性疾病。
子宫和阴道
如果排卵后没有怀孕，子宫的子宫内膜会脱落，月经就会开始。月经然后通过阴道传出。在子宫因闭经的原因中，排卵通常不受影响，在这种情况下，闭经通常被认为是排卵性闭经。
一些子宫和阴道的闭经原因包括：
子宫肌瘤和息肉引起阻塞。
像TB这样的子宫感染。
阴道和/或子宫(发育不全)的不完全生长和发育。
阴道隔膜。
没有穿孔的处女膜。
真正的或假性两性畸形(雌雄同体)。
使用子宫内装置(IUD)。
生育，流产和流产手术，如扩张和刮宫术(d&c)
闭经的许多子宫和阴道原因都是先天性的，这意味着它从出生时就存在(出生缺陷)。
系统性和其他原因
除了上述慢性和全身性病因外，其他可能导致闭经的病症包括：
甲状腺疾病 - 甲状腺功能亢进或甲状腺机能减退。
肥胖或严重体重不足。
由肿瘤引起的高水平雄激素(雄性激素)。
肿瘤产生高水平的雌激素或HCG(人绒毛膜促性腺激素)。
库欣综合症。
结节病。
重要的是要记住，继发性闭经的更为常见原因是怀孕。更年期或更年期早期(卵巢早衰)是另一个常见原因。在考虑进一步的诊断调查以确定原发性或继发性闭经的原因之前，必须排除这些情况。
