首先需要了解其解剖结构。包皮由角质化的外层(通常是皮肤)和作为粘膜表面的内衬组成。因此，内衬类似于其他粘膜上皮，例如构成子宫颈，鼻腔通道和直肠。有人提出，包皮可以保护龟头免于干燥和角化。但是，组织学检查显示，无论包皮环切状态如何，阴茎头皮肤中的角蛋白含量相同。有趣的是，尽管大多数人认为内包皮较薄，但一项研究报告说内外包皮的角质化之间没有差异。但是，这项研究是
包皮的内层衬有一个“包囊”，它成为脱落细胞，分泌物和尿液残留物的储存库。这也是细菌和其他微生物生长的好客环境。
在勃起过程中，阴茎的头部和杆身会延伸，以使内层沿着杆身的远侧部分变得外部。这在性交过程中将其暴露于传染原。
据推测，包皮是分泌物，信息素等的来源，但鉴于这些报告的可疑之处以及缺乏任何研究支持，这种建议应该被认为是虚构的。
未割包皮的感染风险增加可能是由于以下原因造成的：
包皮使阴茎具有较大的表面积。
有人认为，包皮的湿润内层比包皮和包括阴茎头在内的阴茎其余部分的角质层更外表较薄。应该注意的是，割包皮的和未割包皮的阴茎的龟头具有相同量的角蛋白(即，相似的皮肤厚度和对微生物的入侵的保护作用)。尽管内部和外部包皮的角蛋白厚度被认为是相似的。但所使用的样品来自患有病理学的男性，其角蛋白厚度可能增加，并且可能来自于较厚的远端。包皮。薄而潮湿的内衬可能是病毒和细菌进入人体的潜在切入点，但需要更多信息以了解其发生方式。
包皮过长可能会导致性交时发生更大的微伤，从而使传染源进入血液。
包皮下温暖潮湿的黏膜环境有利于微生物的生长(稍后详细讨论)。甚至有人将前囊称为“感染池”，因为其不幸的解剖结构包裹在阴茎末端，导致分泌物，排泄物积聚(尿液)，死细胞和上述细菌的生长。父母被告知不要缩回男婴的包皮，这会使清洁变得困难。即使进行了最佳清洗，也没有证据表明它可以提供保护。相反，包皮倾向于将微生物捕获并传播给该人本人及其性伴侣。
