当对女性和男性伴侣的标准调查排除其他不孕症诊断时，不明原因的不孕症是排除性的诊断。这并不意味着没有不育的原因，但当时无法确定原因。大约10%至15%的夫妇将接受不明原因不孕症的诊断。
女性的常规不孕症评估可包括：病史，体格检查，血液激素水平测试，排卵功能和子宫输卵管造影(HSG)(子宫和输卵管的X射线)。腹腔镜检查，包括在腹部插入一个薄的，点亮的类似望远镜的器械，以观察子宫，卵巢和输卵管，可能有必要排除子宫内膜异位症和粘连(瘢痕组织)等因素，HSG可能并不明显。
男性的常规不孕症评估可包括：病史，体格检查，精液分析和激素测试。
有时，在体外受精(IVF)时可能会发现不明原因不孕的问题。IVF是一种辅助生殖方法，包括将卵子与精子结合在实验室培养皿中。如果卵子受精并开始细胞分裂，则产生的胚胎然后转移到女性的子宫中。
其他因素
评估和管理不明原因不孕症时要考虑的关键因素是不孕症的持续时间和女性伴侣的年龄。年轻的肥沃夫妇每月有大约20%的自发受孕机会。相比之下，不育不育的夫妇，不育三年以上，自发受孕率为每月1%至2%。很明显，衰老过程与生殖能力下降和流产增加有关，特别是在女性35岁之后。生殖能力(卵巢储备)的测试，可能包括循环第3天水平的卵泡刺激素(FSH)和雌二醇和/或克罗米芬激发试验，可能有助于评估卵巢功能。
